第86回～第90回大会
| 年次 | 平成16年 （2004） |
平成17年 （2005） |
平成18年 （2006） |
平成19年 （2007） |
平成20年 （2008） |
|---|---|---|---|---|---|
| 回数 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 |
| 北北海道 | 旭川北 | 旭川工 | 白樺学園 | 駒大岩見沢 | 駒大岩見沢 |
| 南北海道 | 駒大苫小牧 | 駒大苫小牧 | 駒大苫小牧 | 駒大苫小牧 | 北海 |
| 青森 | 青森山田 | 青森山田 | 青森山田 | 青森山田 | 青森山田 |
| 岩手 | 盛岡大付 | 花巻東 | 専大北上 | 花巻東 | 盛岡大付 |
| 秋田 | 秋田商 | 秋田商 | 本荘 | 金足農 | 本荘 |
| 山形 | 酒田南 | 酒田南 | 日大山形 | 日大山形 | 酒田南 |
| 宮城 | 東北 | 東北 | 仙台育英 | 仙台育英 | 仙台育英 |
| 福島 | 聖光学院 | 聖光学院 | 光南 | 聖光学院 | 聖光学院 |
| 茨城 | 下妻二 | 藤代 | 常総学院 | 常総学院 | 常総学院 |
| 栃木 | 宇都宮南 | 宇都宮南 | 文星芸大付 | 文星芸大付 | 白鴎大足利 |
| 群馬 | 桐生第一 | 前橋商 | 桐生第一 | 前橋商 | 桐生第一 |
| 埼玉 | 浦和学院 | 春日部共栄 | 浦和学院 | 浦和学院 | (北)本庄一 |
| (南)浦和学院 | |||||
| 千葉 | 千葉経大付 | 銚子商 | 千葉経大付 | 市船橋 | (東)木更津総合 |
| (西)千葉経大付 | |||||
| 東東京 | 修徳 | 国士舘 | 帝京 | 帝京 | 関東一 |
| 西東京 | 日大三 | 日大三 | 早稲田実 | 創価 | 日大鶴ヶ丘 |
| 神奈川 | 横浜 | 桐光学園 | 横浜 | 桐光学園 | (北)慶応 |
| (南)横浜 | |||||
| 新潟 | 日本文理 | 新潟明訓 | 日本文理 | 新潟明訓 | 新潟県央工 |
| 長野 | 塚原青雲 | 松商学園 | 松代 | 松商学園 | 松商学園 |
| 山梨 | 東海大甲府 | 日本航空 | 甲府工 | 甲府商 | 日本航空 |
| 静岡 | 東海大翔洋 | 静清工 | 静岡商 | 常葉菊川 | 常葉菊川 |
| 愛知 | 中京大中京 | 愛工大名電 | 愛工大名電 | 愛工大名電 | (東)大府 |
| (西)東邦 | |||||
| 岐阜 | 県岐阜商 | 土岐商 | 県岐阜商 | 大垣日大 | 市岐阜商 |
| 三重 | 鈴鹿 | 菰野 | 三重 | 宇治山田商 | 菰野 |
| 富山 | 富山商 | 高岡商 | 福岡 | 桜井 | 高岡商 |
| 石川 | 遊学館 | 遊学館 | 金沢 | 星稜 | 金沢 |
| 福井 | 福井 | 福井商 | 福井商 | 福井商 | 福井商 |
| 滋賀 | 北大津 | 近江 | 八幡商 | 近江 | 近江 |
| 京都 | 京都外大西 | 京都外大西 | 福知山成美 | 京都外大西 | 福知山成美 |
| 大阪 | PL学園 | 大阪桐蔭 | 大阪桐蔭 | 金光大阪 | (北)大阪桐蔭 |
| (南)近大付 | |||||
| 兵庫 | 報徳学園 | 姫路工 | 東洋大姫路 | 報徳学園 | (東)報徳学園 |
| (西)加古川北 | |||||
| 奈良 | 天理 | 天理 | 天理 | 智弁学園 | 智弁学園 |
| 和歌山 | 市和歌山商 | 智弁和歌山 | 智弁和歌山 | 智弁和歌山 | 智弁和歌山 |
| 岡山 | 岡山理大付 | 関西 | 関西 | 岡山理大付 | 倉敷商 |
| 広島 | 広島商 | 高陽東 | 如水館 | 広陵 | 広陵 |
| 鳥取 | 鳥取商 | 鳥取西 | 倉吉北 | 境 | 鳥取西 |
| 島根 | 浜田 | 江の川 | 開星 | 開星 | 開星 |
| 山口 | 岩国 | 宇部商 | 南陽工 | 岩国 | 下関工 |
| 香川 | 尽誠学園 | 丸亀城西 | 香川西 | 尽誠学園 | 香川西 |
| 徳島 | 鳴門第一 | 鳴門工 | 徳島商 | 徳島商 | 鳴門工 |
| 愛媛 | 済美 | 済美 | 今治西 | 今治西 | 済美 |
| 高知 | 明徳義塾 | 高知 | 高知商 | 高知 | 高知 |
| 福岡 | 西日本短大付 | 柳川 | 福岡工大城東 | 東福岡 | 飯塚 |
| 佐賀 | 佐賀学園 | 佐賀商 | 佐賀商 | 佐賀北 | 佐賀商 |
| 長崎 | 佐世保実 | 清峰 | 清峰 | 長崎日大 | 清峰 |
| 熊本 | 熊本工 | 熊本工 | 熊本工 | 八代東 | 城北 |
| 大分 | 明豊 | 別府青山 | 鶴崎工 | 楊志館 | 日田林工 |
| 宮崎 | 佐土原 | 聖心ウルスラ | 延岡学園 | 日南学園 | 宮崎商 |
| 鹿児島 | 鹿児島実 | 樟南 | 鹿児島工 | 神村学園 | 鹿児島実 |
| 沖縄 | 中部商 | 沖縄尚学 | 八重山商工 | 興南 | 浦添商 |
| 優勝校 | 駒大苫小牧 | 駒大苫小牧 | 早稲田実 | 佐賀北 | 大阪桐蔭 |
| 決勝成績 | 13-10 | 5-3 | （1-1，4-3） | 5-4 | 17-0 |
| 準優勝校 | 済美 | 京都外大西 | 駒大苫小牧 | 広陵 | 常葉菊川 |
| 本塁打数 | 33 | 32 | 60 | 24 | 49 |
| 全参加校数 | 4146 | 4137 | 4112 | 4081 | 4059 |
| 代表校数 | 49 | 49 | 49 | 49 | 55 |